Trong 6 tháng đầu năm 2012, Liên hiệp các Hội Khoa học và Kỹ thuật đã tổ chức thực hiện có kết quả một số nhiệm vụ công tác như: tham mưu để Thường trực Tỉnh ủy ban hành Quy chế phối hợp giữa Đảng đoàn Liên hiệp hội với các Huyện, Thị, Thành ủy trực thuộc Tỉnh uỷ, các Đảng đoàn, Ban cán sự đảng có liên quan; Phản biện “Quy hoạch, phát triển ngành Y tế Phú Yên đến năm 2020, tầm nhìn đến năm 2030” và tham gia Hội đồng thẩm định một số quy hoạch về phát triển kinh tế xã hội của tỉnh.